我们科研团队已经研发出国际独创的硒修饰核苷酸。一个或多个核酸氧原子被硒原子取代的核酸被称为硒核酸,这种取代方式被称为硒氧同族取代。我们利用硒核酸来建立新颖的DNA(或RNA)检测技术。硒核酸的重要特性之一就是使碱基互补配对的准确性显著增加,让DNA(或RNA)的检测更准确。并且DNA聚合酶(包括反转录酶)可以高效地将硒核苷酸掺入到DNA中。通过单个原子的改变(硒取代氧),硒核酸可以加强核酸分子特异性识别,并用于分子检测诊断。我们已经完成硒核酸单体(硒代亚磷酰胺和硒代核苷三磷酸)的设计和合成多硒修饰的核酸,把多个硒原子引入到核酸分子中,并用于核酸分子识别和检测诊断研发。硒核酸提高碱基的保真性,从而增加聚合酶的特异性,大大减少甚至消除检测信号放大过程中的副产物产生,从而提高信号的高时效性和高特异性放大,即硒核酸分子检测可以达到高准确度(抗非特异性核酸的干扰与非核酸类物质的干扰)和高灵敏度(可达个位数核酸分子检测)。就HPV检测而言,我们已经从硒核酸检测技术出发,基于病毒各个亚型的特征基因来设计高效的硒核酸分子探针。
另外,为进一步提高分子检测的灵敏度和选择性,CRISPR/Cas12a介导检测探针的设计也十分重要。对于宫颈癌及其HPV病原体标志核酸,该项目拟根据病原微生物核酸具有的基因序列特征,设计相应具有独特序列的特异性识别探针,以便提高检测灵敏度和对靶标核酸分子进行RPA准确扩增。双链靶标DNA分子,通过RPA扩增,产生与靶标dsDNA序列一致的dsDNA;靶标RNA分子可直接使用反转录RPA扩增成对应的双链DNA。Cas12a反式切割活性被靶标激活,对信号探针进行持续性的切割,检测信号会源源不断地被放大,实现通过CRISPR/Cas12a对核酸靶标进行超灵敏检测。对于宫颈癌及其HPV病原体标志蛋白分子,项目拟依据其特异性适配体设计相应的发卡结构,在不存在目标蛋白分子时,该发卡结构不能触发后续的SDA扩增,产生不了能够激活CRISPR/Cas12a反式切割活性的激活链DNA;当存在目标物时,目标蛋白分子与适配体结合,使发卡探针能够触发SDA扩增的核酸序列,触发SDA扩增,产生能够激活CRISPR/Cas12a反式切割活性的激活链DNA。总之,通过硒核酸技术整合CRISPR-Cas技术,该项目极大地提高宫颈癌和HPV病毒检测筛查的灵敏度和准确性